Conception de la mise en page du laboratoire NGS

Dans le domaine des sciences de la vie modernes et de la recherche médicale, les laboratoires NGS (séquençage de nouvelle génération) jouent un rôle vital. Un design de mise en page scientifique et raisonnable d'un laboratoire NGS peut non seulement garantir le progrès efficace des expériences, mais aussi l'exactitude et la fiabilité des résultats expérimentaux.

La technologie NGS peut séquencer rapidement et avec précision un grand nombre de séquences d'ADN ou d'ARN et est largement utilisée dans le diagnostic des maladies, la recherche sur la fonction des gènes, le dépistage des maladies génétiques et de nombreux autres aspects. Cependant, en raison de la sensibilité des expériences NGS à l'environnement et des exigences élevées pour les échantillons, la conception de l'agencement du laboratoire doit être soigneusement planifiée.

Le laboratoire NGS devrait être divisé en différentes zones fonctionnelles, comprenant principalement la zone de réception des échantillons, la zone de préparation des échantillons, la zone de construction de bibliothèques, la zone de séquençage et la zone d'analyse des données. Chaque zone a ses fonctions spécifiques et ses processus opérationnels, et une zonage clair peut prévenir la contamination croisée entre les différentes étapes expérimentales. Par exemple, la zone de réception des échantillons est principalement responsable de la réception et de l'enregistrement des échantillons entrants, tandis que la zone de séquençage est dédiée à l'exécution des réactions de séquençage. L'isolement physique entre les deux peut empêcher la contamination des échantillons pendant les premières étapes du traitement, affectant ainsi les résultats de séquençage.

La disposition du laboratoire doit être conçue en fonction du processus expérimental NGS. À partir de l'entrée des échantillons dans le laboratoire, les différentes zones doivent être disposées en séquence le long du processus de traitement des échantillons, de construction de bibliothèque, de séquençage et d'analyse des données, de sorte que les échantillons et les données puissent circuler dans un flux unidirectionnel et raisonnable. Cela peut minimiser les déplacements des personnels de laboratoire pendant le processus opérationnel, réduire le risque de contamination et améliorer l'efficacité du travail. Par exemple, une fois la préparation des échantillons terminée, les échantillons peuvent être directement transférés à la zone de construction de bibliothèque par une fenêtre de passage sans passer par d'autres zones non pertinentes.

Pour réduire davantage la possibilité de contamination, les itinéraires de mouvement du personnel et de flux de matériel doivent être conçus séparément. Le personnel dispose de passages dédiés pour entrer dans chaque zone expérimentale, tandis que les échantillons, les réactifs et d'autres articles sont transférés par des canaux de flux de matériel indépendants. Dans certaines zones clés, comme la zone de séquençage, des salles tampons peuvent être mises en place, et le personnel et les matériaux entrent par différentes salles tampons pour éviter la contamination croisée à l'entrée.

En plus de la conception de l'aménagement et des flux de travail, le laboratoire doit également adopter diverses mesures de contrôle de la contamination. Par exemple, des lampes de désinfection ultraviolettes doivent être installées dans chaque zone pour désinfecter régulièrement le laboratoire. Dans les zones clés, telles que la zone de construction de la bibliothèque et la zone de séquençage, un système à pression positive doit être utilisé pour empêcher l'air contaminé extérieur d'entrer. En même temps, le personnel du laboratoire doit strictement respecter les procédures d'exploitation et porter des vêtements de protection appropriés, des masques, des gants, etc.

Les laboratoires NGS doivent être équipés de dispositifs complets de lutte contre l'incendie, y compris des extincteurs, des bouches d'incendie, etc. En même temps, compte tenu de la nature spéciale du laboratoire, des douches d'urgence et des stations de lavage oculaire doivent être mises en place pour faire face à d'éventuelles situations accidentelles telles que des éclaboussures de réactifs chimiques. De plus, le système électrique du laboratoire doit répondre aux normes de sécurité pour prévenir les incendies ou d'autres problèmes de sécurité causés par des pannes électriques.

La conception de l'agencement d'un laboratoire NGS est un projet complexe et systématique qui nécessite une prise en compte complète de plusieurs facteurs tels que le processus expérimental, le contrôle de la contamination et la sécurité du personnel. Ce n'est qu'avec une conception soignée qu'un laboratoire NGS de haute qualité peut être créé pour fournir un soutien solide à la recherche en sciences de la vie et au diagnostic médical.